Ces sondes sont méticuleusement sélectionnées pour une spécificité et une sensibilité optimalisées et, sont fournies dans la solution d’hybridation, prêtes à l'emploi dans un format de 10 tests.

 

En savoir plus sur :  Her2/Cen17,  EGFR/Cen7,  ABL1/BCR,  MLL,  PML/RARA,  RB1, IGH Break Apart, D13S25/D13S1009, TP53/RARA, FGFR3/IGH, AML1/ETO, MYH11/CBFB

 

Bientôt disponibles :

• Les Multiples Myélomes (MM) :
  CCND1/IGH (r/g) t(11:14)
  D5S2095, D9S64, D15S169 (r/g/go) Hyperploidy 5, 9, & 15 Copy #
• Les Syndromes Myélodysplasiques (MDS) :
  EGR1/D5S2095 (r/g) del(5q31)
  CSFR1/D5S2095 (r/g) del(5q32)
  D20S108 & Cen8 (r/g) del(20q)

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La FISH est applicable à une variété d’échantillons comme le sang, la moelle épinière et coupes de tissus inclus en paraffine.

Aujourd'hui la FISH est très utile pour les échantillons de tumeurs solides d’un grand intérêt clinique et dont les cellules se divisent peu. Par exemple, la FISH est utilisée dans le cancer du sein pour confirmer les cas positifs d’amplification du gène HER-2/neu mis en évidence en immunohistochimie (IHC). De plus, l’utilisation de sondes marquées avec différents fluorophores permet la détection simultanée de plusieurs sites chromosomiques.

ex. FISH  ERBB2 (Her2) / Cen17 Two Color, Amplification Probe

FISH Her2(rouge)/Cen17(vert) Amplifié	FISH Her2(rouge)/Cen17(vert) Non-amplifié

L’hybridation in situ à révélation fluorescente (FISH) est un outil performant et incontournable pour le diagnostic clinique des anomalies chromosomiques telles que les délétions, duplications et translocations. Un des avantages clé de la technique FISH est qu’elle permet l’analyse des chromosomes sur noyaux interphasiques  alors que les techniques de cytogénétiques classiques requièrent des cellules en division et donc une étape préliminaire de culture cellulaire.

Pour la plupart des sondes à translocation, la conception se fait selon une approche innovante et brevetée. Ces sondes, contrairement à la FISH conventionnelle, s’hybrident aux chromosomes dans des régions en-dehors des points de cassure et parfois même en-dehors du gène impliqué dans le réarrangement (US Patent7,585,964 B2).

Fondamentalement, la technique FISH est basée sur le principe de l’hybridation d’une sonde d’ADN (ou d’ARN) marquée (fluorescente) avec un brin d’ADN complémentaire issu de l’ADN génomique d’un patient. La technique comporte 4 étapes : la fixation de l’échantillon sur lame de microscope, la dénaturation de la sonde et de l’ADN cible, l’hybridation de la sonde marquée à la séquence homologue de l’ADN génomique et la détection des hybrides formés par microscopie épifluorescente (spot lumineux).
La FISH  joue un rôle critique dans la confirmation des syndromes microdélétionnels, la majorité des délétions spécifiques étant de taille inférieure au pouvoir de résolution du caryotype en bande.  Dans ce cas, des sondes de 0.1 à 1 Mégabase  (cDNAs ou fragments de DNA génomique clonés) sont utilisées.

Dans le cadre de la détection et de la cartographie d’anomalies génétiques hautement spécifiques des cancers, la FISH est aujourd’hui utilisée aussi bien en recherche fondamentale, pour l'identification et la caractérisation structurale et fonctionnelle des gènes impliqués qu’en recherche appliquée, pour le développement d'outils diagnostiques, pronostiques ou thérapeutiques.

ex. FISH  t(9;22)(q34;q11) ABL1 / BCR Two Color, Two Fusion Translocation Probe

LES SONDES DISPONIBLES

1) HER2/Cen17 - Référence 22-003

Description    Sonde FISH ERBB2 (HER2/neu)(Rouge) / Cen17 (Vert), Ref 22-003

Format          10 tests
Méthode        Fiche technique ERBB2
Sécurité         MSDS-ERBB2

La sonde ERBB2 (HER2/neu) et son contrôle Cen17 est conçue pour détecter l’amplification du gène ERBB2 (HER2) sur le chromosome 17q12 (anciennement assigné à la bande 17q21) relativement au contrôle Cen17 par hybridation in situ en fluorescence (FISH).

HER2 (rouge) / Cen17 (vert) Amplifié

2) EGFr/Cen7 - Référence 22-007

Description    Sonde FISH EGFR (Rouge) /Cen 7 (Vert), Ref 22-007

Format          10 tests
Méthode        Fiche technique EGFr
Sécurité         MSDS-EGFR

 

La sonde EGFR et son contrôle Cen7 est conçue pour détecter l’amplification du gène EGFR sur le chromosome 7p11.2 (anciennement assigné à la bande 7p12) relativement au contrôle Cen7 par hybridation in situ en fluorescence (FISH).

EGFr (rouge) / Cen7 (vert)

3) ABL1/BCR - Référence  10-001

Format           10 tests
Méthode         Fiche technique ABL1/BCR
Sécurité         MSDS-BCR-ABL

La sonde ABL1/BCR t(9;22)(q34;q11) est conçue pour détecter la translocation entre le gène ABL1 sur le chromosome 9q34 et le gène BCR, sur le chromosome 22q11 par hybridation in situ en fluorescence (FISH).

Translocation ABL1/BCR
Spot rouge (ABL1), Spot vert (BCR) et deux fusions

4) MLL - Référence 11-002

Description    Sonde FISH 5' MLL (Vert) / 3' MLL (Rouge) Break Apart 11q23t, Ref 11-002

Format          10 tests
Méthode        Fiche technique MLL
Sécurité         MSDS-MLL

La sonde 11q23/MLL Break Apart est conçue pour détecter les translocations mettant en jeu le gène MLL sur le chromosome 11q23 par hybridation in situ en fluorescence (FISH). Dépendemment des régions impliquées, la sonde peut également détecter des amplifications et des délétions du gène MLL.

Translocation MLL
Spot rouge, Spot vert et Fusion (normal 11)

5) PML/RARA - Référence 12-008

Description    Sonde FISH PML (Vert) /RARA (Rouge) t(15;17)(q24;q21), Ref 12-008

Format          10 tests
Méthode        Fiche technique PML/RARA
Sécurité         MSDS-PML-RARA

La sonde PML/RARA  est conçue pour détecter la translocation entre le gène PML  sur le chromosome 15q24.1 (anciennement assigné à la bande 15q22) et le gène RARA, sur le chromosome 17q21.1 par hybridation in situ en fluorescence (FISH).

Translocation PML/RARA
Spot vert (PML), Spot rouge (RARA) et deux points de fusion (PMLRARA et RARA-PML)

6) RB1 - Référence 27-014

Description    Sonde FISH RB1 (Rouge) /D13S1009 (Vert), Ref 27-014

Format          10 tests
Méthode        Fiche technique RB1
Sécurité         MSDS-RB1

La sonde RB1/D13S1009 est conçue pour détecter la perte du gène RB1 sur le chromosome 13q34 par rapport au marqueur témoin,  D13S1009, sur le chromosome 13q34 par hybridation in situ en fluorescence (FISH).

Délétion RB1/13q34
Spot rouge (RB1), Spot vert (D13S1009) - perte du chromosome 13

7) IGH Break Apart - Référence 13-014

Description    Sonde FISH IGH Break Apart 3'IGHC (rouge)/5' IGHV (vert) (14q32), Ref 13-014

Format          10 tests
Méthode        Fiche technique IGH Break Apart
Sécurité         MSDS-IGH

La sonde DNA-FISH dite "Break Apart" IGH de Cancer Genetics Italia est concue pour detecter les translocations impliquant le locus de la chaine lourde de l’immunogloguline (IGH) sur le chromosome 14q32.3 par hybridation in situ en fluorescence (FISH/Fluorescence in situ hybridization).

Translocation IGH Break Apart
Spot rouge, Spot vert et Fusion (normal 14)

8) D13S25/D13S1009 - Référence 14-009

Description    Sonde FISH D13S25 (rouge)/D13S1009 (vert) del (13q), Ref 14-009

Format          10 tests
Méthode        Fiche technique D13S25/D13S1009
Sécurité         MSDS-D13S25

La sonde DNA-FISH D13S25/D13S1009 de Cancer Genetics Italia est concue pour détecter la perte du gène D13S25 sur le chromosome 13q14 par rapport au marqueur témoin D13S1009 sur le chromosome 13q34 par hybridization in situ en fluorescence (FISH/ Fluorescence in situ hybridization).

Délétion D13S25
Spot rouge (D13S25) et spot vert (D13S1009)

9) TP53/RARA - Référence 14-015

Description    Sonde FISH TP53 (Rouge)/RARA (vert) del(17)(p13), Ref 14-015

Format          10 tests
Méthode        Fiche technique TP53_sur tissu FFPE
Méthode        Fiche technique TP53 sur sang périphérique et moëlle osseuse

La sonde DNA-FISH TP53/RARA de Cancer Genetics Italia est conçue pour détecter la perte du gène TP53 sur le chromosome 17p13 par rapport au marqueur témoin, RARA, sur le chromosome 17q21 par hybridation in situ en fluorescence (FISH/Fluorescence in situ hybridization).

Délétion TP53
Spot rouge (TP53) et spot vert (RARA)

10) FGFR3/IGH - Référence 16-005

Description    Sonde FISH FGFR3 (rouge)/IGH (vert) t(4:14), Ref 16-005

Format          10 tests
Méthode        Fiche technique FGFR3/IGH

La sonde FGFR3/IGH de Cancer Genetics Italia est conçue pour détecter la translocation entre le gène FGFR3 sur le chromosome 4p16 et le gène IGH sur le chromosome 14q32 par hybridation in situ fluorescente (FISH).

Translocation FGFR3/IGH
Spot rouge (FGFR3), spot vert (IGH) et 2 fusions

11) AML1/ETO - Référence 12-005

Description    Sonde FISH AML1 (rouge)/ETO (vert) t(8;21)(q22;q22), Ref 12-005

Format          10 tests
Méthode        Fiche technique AML1/ETO
Sécurité         MSDS-AML1

La sonde AML1/ETO DNA-FISH de Cancer Genetics Italia est conçue pour détecter la translocation entre le gène AML1 (RUNX1) sur le chromosome 21q22 et le gène ETO (RUNX1T1/ MTG8) sur le chromosome 8q22 par hybridation in situ en fluorescence (FISH/Fluorescence in situ hybridization).

Translocation AML1/ETO
Spot rouge (AML1), spot vert (ETO) et 2 fusions

12) MYH11/CBFB - Référence 12-010

Description    Sonde FISH MYH11 (vert)/CBFB (rouge) t(16;16)(p13;q22), Ref 12-010

Format          10 tests
Méthode        Fiche technique MYH11/CBFB
Sécurité         MSDS-MYH11

La sonde MYH11/CBFB DNA FISH de Cancer Genetics Italia est conçue pour détecter l'inversion péricentrique du chromosome 16 (inv(16)) impliquant le gène MYH11 sur le chromosome 16p13 et le gène CBFB sur le chromosome 16q22 par hybridation in situ fluorescente (FISH/Fluorescence in situ hybridization).

Inversion péricentrique MYH11/CBFB
Spot vert (MYH11), spot rouge (CBFB) et 2 fusions

Spécifications des filtres pour l’utilisation des sondes

Fluorophore	Excitation max	Emission max
Vert	496 nm	520 nm
Rouge	580 nm	603 nm
DAPI	360 nm	460 nm

 

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